MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 8783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021881	GCT	2	6	121195	121200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021881	CTAG	2	8	121258	121265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_021881	T	6	6	121274	121279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021881	AT	3	6	121344	121349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021881	TGTTT	2	10	121370	121379	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021881	TAT	2	6	121572	121577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021881	ATC	2	6	121603	121608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021881	TAT	2	6	121672	121677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021881	ATT	2	6	121741	121746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021881	TGC	2	6	121771	121776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021881	ATTGC	2	10	121808	121817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
512	NC_021881	TAT	2	6	121823	121828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021881	CTA	2	6	121852	121857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_021881	ATG	2	6	121874	121879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021881	CTG	2	6	121907	121912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021881	CGT	2	6	122399	122404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021881	TAT	2	6	122418	122423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021881	GAT	2	6	122424	122429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021881	CCT	2	6	122481	122486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_021881	TAT	2	6	122494	122499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021881	GTT	2	6	122547	122552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021881	ATT	2	6	122602	122607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021881	GA	3	6	122615	122620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021881	CAATC	2	10	122644	122653	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
525	NC_021881	TACGTT	2	12	122762	122773	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
526	NC_021881	TAT	2	6	122805	122810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021881	TGT	2	6	122877	122882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021881	CTTT	2	8	122900	122907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_021881	CG	3	6	122941	122946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_021881	CA	3	6	123047	123052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_021881	TAA	2	6	123110	123115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021881	GTCTA	2	10	123168	123177	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
533	NC_021881	ATG	2	6	123265	123270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021881	AC	3	6	123281	123286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_021881	AC	3	6	123328	123333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_021881	AAC	2	6	123337	123342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021881	ATC	2	6	126844	126849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_021881	CTCAA	2	10	126851	126860	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
539	NC_021881	A	6	6	126943	126948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021881	A	6	6	126963	126968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021881	ATG	2	6	126981	126986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021881	TGT	2	6	127085	127090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021881	TTG	2	6	127133	127138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021881	CTGC	2	8	127162	127169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
545	NC_021881	CAGTAT	2	12	127204	127215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
546	NC_021881	GCA	2	6	128062	128067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021881	A	8	8	128095	128102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021881	CG	3	6	129471	129476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_021881	CTT	2	6	129582	129587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021881	AAC	2	6	129629	129634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_021881	AAC	2	6	129800	129805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021881	ACA	2	6	129876	129881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021881	ACC	2	6	130666	130671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_021881	TA	3	6	130805	130810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021881	AT	3	6	130828	130833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021881	TG	3	6	130850	130855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021881	GA	3	6	130905	130910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021881	CGT	2	6	131973	131978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_021881	TAGA	2	8	132002	132009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021881	A	6	6	132068	132073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021881	CT	3	6	132086	132091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_021881	TGC	2	6	132104	132109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_021881	ATC	2	6	132116	132121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021881	AAG	2	6	132206	132211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021881	AC	3	6	132236	132241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_021881	TTGA	2	8	132262	132269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021881	CAC	2	6	133108	133113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_021881	CAAA	2	8	133158	133165	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_021881	AT	3	6	133214	133219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021881	TA	3	6	133266	133271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021881	AGC	2	6	133354	133359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021881	GGC	3	9	133365	133373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_021881	ATT	2	6	133391	133396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021881	AGGA	2	8	133418	133425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021881	GAA	2	6	133451	133456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021881	TGG	2	6	133484	133489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021881	A	6	6	133618	133623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021881	TGC	2	6	133723	133728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_021881	GTT	2	6	133742	133747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021881	CTT	2	6	133761	133766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021881	CATT	2	8	133767	133774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_021881	ATT	2	6	133800	133805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021881	TAT	2	6	134080	134085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021881	CTG	2	6	134135	134140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021881	TC	3	6	134166	134171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_021881	CTAT	2	8	134761	134768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_021881	AT	3	6	134780	134785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021881	ACC	2	6	134787	134792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_021881	GC	3	6	134814	134819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_021881	AAT	2	6	135428	135433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021881	CCG	2	6	136013	136018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_021881	ATC	2	6	136026	136031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_021881	GCAG	2	8	136045	136052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
594	NC_021881	ATC	2	6	136053	136058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021881	CAA	2	6	136073	136078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021881	GGT	2	6	136082	136087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021881	C	6	6	136093	136098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
598	NC_021881	TTA	2	6	136266	136271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021881	AGGT	2	8	136274	136281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021881	GTAC	2	8	136299	136306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_021881	GTGA	2	8	136344	136351	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021881	GAA	2	6	136468	136473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021881	TGC	2	6	137377	137382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021881	AAC	2	6	137403	137408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021881	CTCAT	2	10	137448	137457	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
606	NC_021881	AGA	2	6	137472	137477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021881	TAG	2	6	138276	138281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021881	CGAG	2	8	138325	138332	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
609	NC_021881	AT	3	6	138334	138339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021881	GTGA	2	8	138415	138422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021881	ATA	2	6	138515	138520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021881	T	7	7	138521	138527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021881	AT	3	6	138533	138538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021881	A	6	6	138575	138580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021881	TAG	2	6	138648	138653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021881	AATT	2	8	138657	138664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021881	TAT	2	6	138690	138695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021881	TGA	2	6	138791	138796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021881	ATT	2	6	138807	138812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021881	GT	3	6	138814	138819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021881	TGT	2	6	138949	138954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021881	T	6	6	138969	138974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021881	T	6	6	142580	142585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021881	CA	3	6	142591	142596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_021881	AAG	2	6	142620	142625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021881	ACA	2	6	145308	145313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021881	AGC	2	6	145431	145436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021881	CTTA	2	8	145445	145452	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_021881	TGTA	2	8	145462	145469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021881	TGCA	2	8	146011	146018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_021881	ATTA	2	8	146084	146091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021881	CGG	2	6	146113	146118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_021881	TAAT	2	8	146178	146185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021881	AAGT	2	8	146282	146289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021881	CAA	2	6	146321	146326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_021881	CAA	2	6	146349	146354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_021881	CAT	2	6	146360	146365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_021881	CAA	2	6	147798	147803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_021881	ACC	2	6	147804	147809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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